Toda a Unidade de Conservação precisa de um plano de manejo que defina diretrizes para a gestão da área. Um plano de manejo deve conter informações sobre o local, normas de uso, zoneamento e ações prioritárias, com base em seus objetivos de criação.
O IPÊ desenvolve Planos de Manejo, sempre em parceria com gestores das UCs, organizações municipais, estaduais e federais e demais responsáveis envolvidos.